Domaines scientifiques
Mots-clés
ITMO
Gael Cristofari Docteur en Sciences de la Vie
Parcours et situation actuelle
Parcours académique
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2008 |
Habilitation à Diriger les Recherches (HDR), ENS de Lyon, France |
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2002 |
Doctorat en Sciences de la Vie, ENS de Lyon, France |
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1999 |
DEA en Biologie, Université de Lyon et ENS de Lyon, France |
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1999 |
Agrégation de Biochimie et Génie Biologique |
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1995-1999 |
Elève normalien, ENS de Lyon, France |
Expérience professionnelle
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2024-présent |
Membre du GDR sur les interactions entre chromatines virale et cellulaire (CNRS GDR Dynavir) |
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2016-présent |
Directeur de Recherche (Inserm DR2), IRCAN, Nice, France |
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2016-présent |
Directeur adjoint GDR Eléments Transposables (CNRS GDR 3546) |
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2010-présent |
Membre fondateur et responsable d’équipe à l’IRCAN, Nice, France Rétrotransposons et dynamique du génome dans le cancer et le vieillissement. |
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2007-2009 |
Chargé de Recherche (Inserm CR1), ENS-Lyon, Lyon, France Régulation des transcriptases inverses cellulaires et virales. |
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2002-2007 |
Chercheur post-doctoral, laboratoire du Pr. Joachim Lingner, Institut Suisse de Recherche Expérimentale sur le Cancer (ISREC), Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Suisse. Télomérase et homéostasie de télomères chez l’Homme. |
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1999-2002 |
Doctorant, laboratoire du Pr. Jean-Luc Darlix, ENS-Lyon, Lyon, France. Mécanismes moléculaires de la réplication des rétrotransposons chez la levure S. cerevisiae. |
Prix et distinctions
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2020 |
Prix Henry et Mary-Jane Mitjavile de l’Académie Nationale de Médecine |
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2018-présent |
Lauréat du programme transversal de l’Inserm “Variabilité génomique” |
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2018-présent |
Equipe labellisée par la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) |
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2010-2014 |
Lauréat du Conseil Européen de la Recherche (ERC Starting Grant) |
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2009 |
Lauréat du programme Inserm Avenir |
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2009 |
Prix Albert Sézary de l’Académie Nationale de Médecine |
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2003-2004 |
Bourse post-doctorale EMBO |
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2003 |
Prix Jacques Piraud de la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) |
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2002 |
Bourse de la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) |
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2000 |
Prix de DEA des Amis de l’Université de Lyon |
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1999-2002 |
Allocataire Moniteur Normalien |
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1995-1999 |
Elève normalien |
Expertise
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2023 |
Membre d'un Comité d'experts de Cancer Research UK |
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2021-présent |
Membre du Comité National de la Recherche Scientifique (Section 24, CNRS, FR) |
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2021-2023 |
Membre du comité d'expertise scientifique du programme de recherches avancées de l'Idex JEDI (University Côte d’Azur, FR) |
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2021-présent |
Expert de l'ITMO Cancer (Aviesan, FR) |
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2021-présent |
Editeur invité, Frontiers in Aging (specialty Genetics, Genomics and Epigenomics of Aging) |
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2020-2021 |
Membre du Conseil Académique de l'Université Côte d’Azur |
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2019-présent |
Editeur associé, Mobile DNA |
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2018 |
Expert pour le Haut Conseil de l'évaluation de la recherche et de l'enseignement supérieur (Hcéres) |
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2016-présent |
Ad hoc reviewer, Bioinformatics, Br J Cancer, Cancer Discov, Cell, Cell Chem Biol, Cell Rep, Cell Rep Methods, Cell Res, Development, eLife, EMBO J, Epigenetics, FEBS Lett, Genome Biol, Genome Res, J Clin Invest, Mob DNA, Mol Biol Evol, NAR Cancer, Nat Aging, Nat Commun, Nat Genet, Nat Struct Mol Biol, Nature, Nucleic Acids Res, PLoS Biol, PLoS Genet, PNAS, Review Commons, Sci Adv, Stem Cell Reports, Trends Genet |
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2016-présent |
Membre de l'Académie scientifique de l'Idex JEDI (Université Côte d'Azur) |
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2014 |
Membre du comité d'expertise scientifique, Agence Nationale de la Recherche (ANR) |
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2014-2019 |
Membre du comité éditorial, Mobile DNA |
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2012-présent |
Ad hoc grant reviewer ou évaluateur académique, European Research Council (ERC), Human Frontier Science Program (HFSP), Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC, UK), Cancer Research UK (UK), Medical Research Foundation (UK), Wellcome Trust (UK), Newcastle University (UK), Swiss Cancer League (CH), Swiss National Science Foundation (SNSF, CH), Massachusetts General Hospital (US), Harvard Medical School (US), Univ. of Rochester (US), Israel Science Foundation (IL), Agricultural Genomics Institute at Shenzhen (CN), National Research Agency (ANR, FR), Canceropoles (FR), and several other regional calls.Ad hoc reviewer pour des institutions, ERC (European Research Council), Human Frontier Science Program (HFSP), Wellcome Trust (UK), Medical Research Foundation (UK), Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC, UK), National Research Agency (ANR, FR), Swiss Cancer League (CH), Massachusetts General Hospital (US), Harvard Medical School (US), Newcastle University (UK), Israel Science Foundation (IL), Canceropoles (FR), and several other regional calls. |
Résumé scientifique
Intérêt scientifique
Le cancer, comme le vieillissement normal ou pathologique, se caractérise par l'accumulation d'altérations génétiques et épigénétiques. Nos travaux cherchent principalement à comprendre comment les éléments transposables contribuent à ces altérations, et quelles sont les conséquences fonctionnelles et physiologiques de cette forme de plasticité (épi)génomique.
Publications choisies
- sur 57 publications; h-index: 28; total citations: 4241 [Google scholar consulté le 18/03/2024]
- Lanciano S*, Philippe C*, Sarkar A, Pratella D, Domrane C, Doucet AJ, van Essen D, Saccani S, Ferry L, Defossez PA, Cristofari G. Locus-specific L1 DNA methylation profiling reveals the epigenetic and transcriptional interplay between L1s and their integration sites. Cell Genom. 2024 Feb 14 4:100498 (*co-first authors)
- Cristofari G. Snapshots of genetic copy-and-paste machinery in action. Nature. 2024 Feb;626(7997):40-42 (news & views)
- Lanciano S, Cristofari G. Flip-flop genomics: Charting inversions in the human population. Cell. 2022 May 26;185(11):1811-1813. (preview)
- Lanciano S, Cristofari G. Measuring and interpreting transposable element expression. Nat Rev Genet. 2020 Dec;21(12):721-736. (review)
- Tristán-Ramos P, Rubio-Roldan A, Peris G, Sánchez L, Amador-Cubero S, Viollet S, Cristofari G, Heras SR. The tumor suppressor microRNA let-7 inhibits human LINE-1 retrotransposition. Nat Commun. 2020 Nov 11;11(1):5712.
- Sultana T*, van Essen D*, Siol O, Bailly-Bechet M, Philippe C, Zine El Aabidine A, Pioger L, Nigumann P, Saccani S, Andrau JC, Gilbert N, Cristofari G. (2019) The landscape of L1 retrotransposons in the human genome is shaped by pre-insertion sequence biases and post-insertion selection. Mol Cell. 74(3): 555–570 (*co-first authors)
- Sultana T*, Zamborlini A*, Cristofari G#, Lesage P#. (2017) Integration site selection by retroviruses and transposable elements in eukaryotes. Nat Rev Genet. 18(5): 292-308 (*co-first, #co-corresponding authors)
- Philippe C, Vargas-Landin DB, Doucet AJ, van Essen D, Vera-Otarola J, Kuciak M, Corbin A, Nigumann P, Cristofari G. (2016) Activation of individual L1 retrotransposon instances is restricted to cell-type dependent permissive loci. eLife. 5: e13926
- Mir AA, Philippe C, Cristofari G. (2015) euL1db: the European database of L1HS retrotransposon insertions in humans. Nucleic Acids Res. 43:D43-47
- Monot C*, Kuciak M*, Viollet S, Mir AA, Gabus C, Darlix JL, Cristofari G. (2013) The specificity and flexibility of L1 reverse transcription priming at imperfect T-tracts. PLoS Genet. 9(5):e1003499
- Goic B, Vodovar N, Mondotte JA, Monot C, Frangeul L, Blanc H, Dorey V, Vera-Otarola J, Cristofari G, Saleh MC. (2013) RNA-mediated interference and reverse transcription control the persistence of RNA viruses in the insect model Drosophila. Nat Immunol. 14:396-403
- Cristofari G, Adolf E, Reichenbach P, Sikora K, et al. (2007) Human telomerase RNA accumulation in Cajal bodies facilitates telomerase recruitment to telomeres and telomere elongation. Mol Cell. 27:882-889
- Cristofari G, Reichenbach P, Regamey PO, Banfi D, et al. (2007) Low- to high-throughput analysis of telomerase modulators with Telospot. Nat Methods. 4:851-853.
- Cristofari G, Lingner J. (2006) Telomere length homeostasis requires that telomerase levels are limiting. EMBO J. 25, 565-574
- Cristofari G, Bampi C, Wilhelm M, Wilhelm FX, Darlix JL. (2002) A 5'-3' long-range interaction in Ty1 RNA controls its reverse transcription and retrotransposition. EMBO J. 21(16):4368-79
