Etienne Ruppé
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English versionEtienne Ruppé

Dernière mise à jour 2022-01-10 18:19:58.41

Etienne Ruppé Thèse d'Université en Infectiologie

Parcours et situation actuelle

Etienne Ruppé (PharmD, PhD) est bactériologiste clinique. Après avoir suivi des études de Pharmacie puis Biologie Médicale dans les Universités de Tours et Paris 5, il a travaillé au développement d'un automate de détection des principaux gènes de résistance aux antibiotiques dans le microbiote intestinal au sein du laboratoire de bactériologie de l'hôpital Bichat-Claude Bernard (Pr Antoine Andremont) à Paris, dans le cadre du projet NOSOBIO (financé en partie par la banque d'investissement OSEO). Puis il a effectué son assistanat hospitalo-universitaire dans le laboratoire de bactériologie de l'hôpital Bichat-Claude Bernard (Pr Antoine Andremont) à Paris. Il y effectue son travail de thèse d'université autour de l'épidémiologie du commensalisme à entérobactéries multirésistantes, et participe en tant que responsable scientifique au projet VOYAG-R qui vise à mesurer le taux d’acquisition d’entérobactéries multirésistantes durant un voyage en zone tropicale. Il part ensuite effectuer un premier stage post-doctoral dans le démonstrateur pré-industriel MetaGenoPolis créé par les Pr Dusko Ehrlich et Joël Doré de l'INRA de Jouy-en-Josas. Dans le cadre du projet européen EvoTAR, il travaille à l'identification des gènes de résistance aux antibiotiques dans le microbiote intestinal et à leur dynamique lors de diverses expositions aux antibiotiques. Puis il part effectuer un second stage post-doctoral dans le laboratoire de recherche génomique des Hôpitaux Universitaires de Genève (Pr Jacques Schrenzel) dans lequel il travaille au développement de la métagénomique clinique. Avec le Pr Schrenzel, il a notamment fondé la première conférence internationale de métagénomique clinique (ICCMg) à Genève, dont trois éditions ont eu lieu à ce jour. Il a été nommé en 2017 maître de conférence des universités – praticien hospitalier à l’université Paris Diderot et l’hôpital Bichat-Claude Bernard, puis professeur des universités – praticien hospitalier en 2021. Son domaine d'expertise est la résistance aux antibiotiques dans une approche globale.

Résumé scientifique

Ma thématique de recherche porte sur la résistance aux antibiotiques, notamment sur les interactions entre les microbiotes et l’émergence de bactéries résistantes, la dynamique des gènes de résistance aux antibiotiques (le résistome) et le diagnostic des infections en m’appuyant notamment sur l’application des nouveaux outils de séquençage 

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